摘要  植物通过小干扰RNA(siRNA)介导的RNA干扰机制来防御外来病毒感染，通过对感病植物材料小RNA(sRNA)的深度测序，获得这一过程中产生的与病毒序列高度一致的siRNA序列信息，可以快速地鉴定侵染植物的病毒组成。以采集自浙江省桐乡市桑园疑似感染桑花叶卷叶病（原称桑花叶型萎缩病）的桑树叶片为材料提取总RNA，构建sRNA文库并进行深度测序，对测序得到的总sRNA进行组装后，比对鉴定出桑花叶卷叶病相关病毒(mulberry mosaic leaf rollassociated virus,MMLRaV)，并分别得到占MMLRaV 2个组分全基因组14.19%和21.6%的核酸序列。进一步以感病桑叶组织的总RNA为模板，通过RTPCR扩增获得部分MMLRaV基因组序列，经Sanger测序确定采集的感病桑树叶片中只存在MMLRaV。通过生物信息学方法分析表明，MMLRaV来源siRNA在基因组中的长度分布、5′端碱基偏好性及热点区分布等具有明显特点。研究结果显示，利用siRNA深度测序技术鉴定桑树病毒是非常高效的手段。

关键词  桑花叶卷叶病相关病毒； 深度测序； 小干扰RNA； 生物信息学分析