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  • 国内刊号:CN 32-1115/S
  • 国际刊号:ISSN 0257-4799
  • 主管部门:中国科学技术协会
  • 主办单位:中国蚕学会
    中国农业科学院蚕业研究所
  • 主编:李木旺
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基于EST数据的柞蚕SSR标记开发

【期刊年份】2016年第01期
【作者姓名】郑茜茜 马红方 谌苗苗 钟亮 李群 王欢 夏润玺 李喜升 王凤成 刘彦群
【作者单位】沈阳农业大学生物科学技术学院;辽宁省蚕业科学研究所

摘要  柞蚕SSR标记的开发对研究柞蚕的遗传与进化、分子遗传图谱构建、功能基因定位和克隆等有重要意义。从1 500条柞蚕表达序列标签(EST)中鉴定了71SSR位点,平均5.2 kb出现1SSR位点,在16个碱基的重复基元中,以3个和4个核苷酸重复为主导类型。设计合成了29EST-SSR引物,通过PCR扩增和电泳检测鉴定了7对具有多态性的引物,测序验证结果表明其中的4对为有应用价值的EST-SSR标记。建立的利用EST数据开发柞蚕SSR标记的方法,有助于进一步大量开发柞蚕SSR分子标记。

关键词  柞蚕; 表达序列标签; 简单重复序列