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  • 国内刊号:CN 32-1115/S
  • 国际刊号:ISSN 0257-4799
  • 主管部门:中国科学技术协会
  • 主办单位:中国蚕学会
    中国农业科学院蚕业研究所
  • 主编:李木旺
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从云南蚕区分离BmCPV病毒株的全基因组克隆与系统发育分析

【期刊年份】2015年第06期
【作者姓名】张永红 唐芬芬 邵榆岚 朱峰 白兴荣
【作者单位】云南省农业科学院蚕桑蜜蜂研究所

摘要  家蚕质型多角体病毒(BmCPV)是家蚕中肠型脓病的病原物。从云南蚕区的病蚕样品中分离到一株BmCPV病毒分离株,提取纯化该病毒粒子的总RNA并合成cDNA,克隆病毒全基因组序列,研究该病毒分离株的基因组结构与系统进化。克隆得到该病毒10dsRNA序列(S1S10)并提交至NCBI数据库中。序列分析表明该病毒基因组序列全长24 810 bpS1S10片段序列都具有完整的ORFBLAST比对发现克隆的该病毒基因组各片段编码区序列与已报道的1BmCPV片段的相似度达88%以上,氨基酸序列相似度达90%以上;10dsRNA基因组片段末端均有保守帽子结构5′-AGUAA……GUUAGCC-3′。基于S2 片段RdRp基因的系统进化分析发现,该病毒与其他31BmCPV分离株BmCPV1-SuzhouBmCPV1-ChinaBmCPV1-聚为一支,基于S10 片段polh基因的系统进化分析也表明该病毒为1BmCPV新的分离株系。根据上述研究结果将该病毒定名为BmCPV1-Yunnan

关键词  家蚕质型多角体病毒; 分离株; 基因组片段; 系统进化; RNA聚合酶基因; 多角体蛋白基因