摘要  应用同位素标记相对和绝对定量（iTRAQ）技术结合液相色谱-串联质谱法（LC-MS/MS），分析桑树硬枝扦插生根不同阶段插穗基部皮层的蛋白质组差异，为从分子水平研究桑树扦插生根调控机制提供基础信息。在扦插初期、膨大期、发根期3个阶段的插穗基部皮层共鉴定到4 427种蛋白质，通过对同位素报告基团相对含量的定量检测，共检出2 875种蛋白质。其中，扦插初期和膨大期的差异蛋白质有595种，扦插初期和发根期的差异蛋白质有660种，膨大期和发根期的差异蛋白质有231种。从表达差异显著的蛋白质中筛选出GDP-D-甘露糖基-3’,5’-异构酶、凝集素KM+、生长素IAA水解酶、热激蛋白hsp70、丙二烯氧化物环氧酶、细胞色素b6、过氧化物酶等可能与生根过程密切相关的蛋白质，通过GO功能注释和KEGG数据库比对分析，这些差异蛋白质在扦插生根中主要执行的功能包括代谢过程、多细胞组织进程、定位系统建立、生物学调控、刺激应答、细胞要素、细胞器要素、催化活性和蛋白质结合等，并主要参与次生代谢产物的生物合成、淀粉和蔗糖代谢、内质网蛋白质加工、苯丙素生物合成、糖酵解和糖异生等代谢通路。

关键词  桑树； 硬枝扦插； 生根； 蛋白质组； 同位素标记相对和绝对定量技术； 液相色谱-  串联质谱法