摘要  研究病毒内源性非编码小RNA（VmiRNA）的靶标基因，有助于阐释病毒和宿主的互作关系及制定对病毒的防控策略。利用Solexa高通量测序技术及生物信息学方法，从柞蚕核型多角体病毒（ApNPV）基因组中筛选出VmiRNA成熟体MD5，在预测其作用的宿主靶基因基础上，通过GO数据库分析靶基因的功能。结果显示由ApNPV的VmiRNA MD5调控的宿主靶基因涉及细胞组成、分子功能、生物学过程等生物学途径，主要参与细胞内的分子结合、酶催化和免疫反应，其中与柞蚕免疫相关的靶基因共有4个。实时荧光定量PCR检测柞蚕蛹经ApNPV诱导处理后VmiRNA MD5在脂肪体内明显上调表达（与对照相比提高了8倍），而与宿主免疫相关的3个靶基因的表达水平明显下调。对VmiRNA MD5 5′端上游启动子序列结构的分析显示，其含有免疫相关转录因子GMCSF、p53等的结合位点。推测VmiRNA MD5可能参与调控宿主柞蚕免疫相关基因的表达。

关键词  柞蚕核型多角体病毒； 内源性非编码小RNA； 生物信息学； 靶基因； 启动子