家蚕核型多角体病毒株系的分子鉴定初探
摘要 来自不同地域或蚕区的家蚕核型多角体病毒(BmNPV)对家蚕的致病力存在较大差异,出现明显的株系分化现象。对BmNPV流行株系鉴定是病害监测与防控的重要基础。以最早完成基因组测序的BmNPV-T3株的多角体蛋白基因(polh)序列与其他6个BmNPV株系进行同源基因序列及氨基酸序列的BLAST比对,结果表明不同株系的Polh氨基酸序列高度同源,相似度达到99.94%;再以BmNPV-T3株的143个开放阅读框序列为参照,对不同BmNPV株系的基因组序列进行双序列比对,发现不同株系重复阅读框基因(bro)家族成员的组成、序列及拷贝数存在差异,且分布位置呈现多样性。初步认为,高度保守的polh基因可用于BmNPV病毒的鉴定,而相对保守的bro家族基因可作为BmNPV病毒株系分子鉴定的依据。
关键词 家蚕核型多角体病毒; 株系; 多角体蛋白基因; 杆状病毒重复阅读框基因