联系平台
  • 国内刊号:CN 32-1115/S
  • 国际刊号:ISSN 0257-4799
  • 主管部门:中国科学技术协会
  • 主办单位:中国蚕学会
    中国农业科学院蚕业研究所
  • 主编:李木旺
  • 地址:江苏省镇江市丹徒区长晖路
    666号 江苏科技大学期刊社
  • 邮政编码:212100
  • 电话:0511-85616835
  • 信箱:canyekexue@126.com
  • Q Q:849229965

川桑丝氨酸蛋白酶抑制剂基因的鉴定与表达模式分析

【期刊年份】2014年第04期
【作者姓名】王裕鹏 梁九波 丁光宇 李文生 杨光伟 何宁佳
【作者单位】家蚕基因组生物学国家重点实验室,西南大学蚕学与系统生物学研究所

摘要  丝氨酸蛋白酶抑制剂SPI主要参与蛋白酶活性的调节植物SPI具有抵御病原菌侵染和昆虫取食危害的功能。通过比对MEROPS数据库以及保守氨基酸基序的分析在川桑Morus notabilis基因组中鉴定到34SPI蛋白。这些SPI蛋白可分为KunitzSerpinPI-3个家族,依据氨基酸序列中的半胱氨酸残基数目又将Kunitz家族成员分为4类。氨基酸多序列比对表明SerpinPI-家族成员在序列上相对保守。基于川桑根、皮、花、芽、叶的RNAseq数据量化的RPKM值分析发现不同类型SPI基因的组织表达模式存在差异暗示川桑不同类型SPI行使不同的生物学功能。以广东桑Morus atropurpurea品种粤桑-69851的幼叶作为创伤处理材料检测PI-家族的6SPI基因对创伤诱导响应的表达模式其中有4个基因不同程度地受到创伤诱导而上调表达推测它们在桑树防御昆虫咬食危害中具有重要作用。 

关键词  川桑丝氨酸蛋白酶抑制剂基因家族表达模式