摘要  为了更全面了解家蚕卵巢培养细胞（BmN）的转录基因及其涉及的功能，对BmN细胞进行深度RNA测序（RNA-seq）。得到的总读段（reads）数为80 968 776条，有效RNA-Seq 数据68 672 812条，reads的平均长度为94.85 bp，有效数据达到84.81%，证实测序数据可信。将有效数据比对家蚕mRNA序列，发现BmN细胞中的10 182个基因有不同程度表达。利用qRT-PCR测定随机选择BmN细胞中7个基因的相对表达水平，与RNA-Seq的结果略有差异，但总体趋势表现一致。以家蚕Actin3 基因作为参照，计算BmN细胞中表达基因读段倍率变化的 log₂(Fold_change)，将 log₂(Fold_change)＞2的基因定义为高表达基因，共有41 个基因在BmN细胞中高表达。选取FPKM值>15且表达水平最高的100个基因进行 GO注释，主要涉及细胞组分、分子功能和生物学进程，富集在细胞组分中的基因比率高于富集在分子功能、生物学进程中的基因比率。KEGG分析显示这100 个高表达基因分布在能量代谢，转录，翻译，折叠、组装和降解以及信号转导等22条通路上。比较发现BmN细胞与家蚕卵巢组织之间的高表达基因存在差异。

关键词  家蚕； BmN细胞； 基因表达； GO注释； KEGG 分析