基于ITS标记分析湖北省收集桑种质资源的亲缘关系
【期刊年份】2013年第02期
【作者姓名】陈仁芳 胡仁俊 李萤 沈曦彤 胡兴明 叶楚华
【作者单位】家蚕基因组生物学国家重点实验室,西南大学生物技术学院;湖北省农业科学院经济作物研究所
摘 要 利用ITS标记从分子水平探讨湖北省境内收集的5个野生桑种、1个栽培桑种、1个变种共17份桑种质资源与外省区的6份桑种质资源之间的亲缘关系,为发掘和利用该地区特有的桑种质资源打下基础。结果表明,基于ITS标记的系统进化树与经典分类方法的结果接近,其中湖北省的4份华桑与四川省的川桑有较近的亲缘关系,同在一个分支;收集的3份蒙桑、1份变种鬼桑、1份鸡桑、5份白桑、1份山桑与广东桑、浙江省的瑞穗桑、云南省的滇桑之间有较近的亲缘关系,并于收集的2份长穗桑以及来自广西的钦州长果桑同在一个分支。利用DnaSP软件分析ITS序列核苷酸多样性,符合被子植物ITS致同进化(concerted evolution)规律,变异主要发生在ITS1。利用AMOVA分析供试桑种质材料的遗传变异主要发生在种间,种间遗传变异率为79.49%,种内遗传变异率为20.51%(P<0.001)。分布于湖北省的桑种质资源处于抗寒屏障范围,是桑属植物迁移到此地后形成的类群。
关键词 桑种质资源; ITS标记;亲缘关系;迁移