桑树MaGH3.6基因的克隆与诱导表达及时间特异性
【期刊年份】2013年第02期
【作者姓名】张晓峰 焦锋 聂浩 刘明鲁 程嘉翎
【作者单位】江苏科技大学蚕业研究所;中国农业科学院蚕业研究所;西北农林科技大学
摘 要 GH3(gretchen hagen 3)是一类由植物生长素吲哚乙酸(AUX/IAA)诱导,编码吲哚3-乙酸酰胺合成酶的基因家族,该基因家族通过调控植物体内的生长素含量,进而调控植物的生长和发育。从桑树茎部皮层克隆了一个桑树GH3基因,并将其命名为MaGH3.6(GenBank登录号:KC349982)。生物信息学分析显示该基因编码611个氨基酸残基,蛋白质分子质量为68.87 kD,无跨膜区域和信号肽序列,而且蛋白质序列相当保守。半木质化与木质化的桑树插穗经萘乙酸(NAA)和吲哚-3-乙酸(IAA)诱导处理后,通过荧光实时定量PCR检测到插穗皮层MaGH3.6的表达水平在0.5 h内急剧增加,并随着时间延长呈逐渐增高趋势,其中NAA诱导处理组MaGH3.6的表达量明显高于IAA诱导处理组。利用Solexa mRNA测序构建的cDNA文库数据分析MaGH3.6在桑树扦插后期根原基和根状突起形成阶段的表达量显著下降。研究结果提示MaGH3.6可由IAA和NAA诱导上调表达,推测该基因的表达量下降可能会引起桑树中IAA的含量增加,继而促进插穗不定根的形成和发育,初步认为该基因在桑树扦插生根过程中扮演重要的角色。
关键词 桑树;扦插; MaGH3.6;基因克隆;序列特征;实时荧光定量PCR