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家蚕Rab1基因的克隆及在裸蛹(Nd)突变品系幼虫丝腺中的表达分析
【期刊年份】2013年第02期
【作者姓名】胡文波 刘春 魏丽婉 赵小明 陈志伟 李琼艳 夏庆友
【作者单位】家蚕基因组生物学国家重点实验室
【作者姓名】胡文波 刘春 魏丽婉 赵小明 陈志伟 李琼艳 夏庆友
【作者单位】家蚕基因组生物学国家重点实验室
摘 要 Rab1基因是大鼠肉瘤鸟苷三磷酸酶（Ras）基因家族的一员，调控囊泡从内质网到高尔基体的运输等重要细胞生理过程。通过生物信息学分析发现，家蚕Rab1（BmRab1）基因CDS长609 bp，含有5个外显子，编码202个氨基酸，位于第25染色体nscaf2823:1286217..1289996(+strand)，与丝素重链基因（fib-H）相距200 kb左右。对正常结茧家蚕品系大造和无丝素分泌的裸蛹（Nd）突变品系的BmRab1的序列结构分析显示：大造和Nd品系的BmRab1 cDNA序列第543个碱基处存在单碱基突变，但翻译的氨基酸序列完全相同；在Nd品系中BmRab1的3′端非翻译区缺失8 bp。组织表达分析结果表明，BmRab1基因在Nd品系4眠和整个5龄期幼虫的后部丝腺异常高量表达，通过荧光定量PCR显示BmRab1在Nd品系5龄第3天幼虫后部丝腺的表达量是大造的3倍左右。进一步对Nd品系与大造的BmRab1上游启动子序列（-2 200 bp）及其内含子进行比较分析发现，Nd品系BmRab1出现了2处缺失，并在第3内含子有81 bp插入，第4内含子453 bp替换了Dz品系的263 bp。初步推测BmRab1可能参与了Nd品系幼虫后部丝腺退化萎缩的生理变化，但该基因是否是导致Nd品系后部丝腺退化萎缩的突变基因，还有待进一步证实。
关键词 家蚕；裸蛹； Rab1基因；丝腺；序列特征；组织表达