摘要  桑椹肥大性菌核病是果桑中发病率最高、危害最严重的病害。本研究利用第二代高通量测序技术，对正常桑椹和感染肥大性菌核病的桑椹进行转录组测序，筛选差异基因，并与GO和KEGG数据库比对进行注释，分析感染肥大性菌核病相关基因。结果显示，测序共获得30.49 GB的数据，组装得到70 788条UniGene序列，其中35 714条UniGene获得注释信息，占全部UniGene的50.45%。差异基因表达分析发现，与对照组相比，感染肥大性菌核病的桑椹中有2 217个基因表达上调，2 724个基因表达下调。根据GO功能分类可分为生物过程、细胞组分和分子功能3大类63项功能组。根据KEGG代谢通路分析，1 578个差异表达基因参与120个信号通路，其中56个基因参与植物激素信号转导，包括木葡聚糖内糖基转移/水解酶（XTH）、蛋白磷酸酶、转运蛋白、生长素应答蛋白、乙烯响应因子、脱落酸受体和多种转录因子等，36个基因参与植物与病原菌相互作用，包括蛋白激酶、钙调蛋白、爆发式氧化酶和分子伴侣等。本研究丰富了桑椹研究的转录组信息，获得了差异表达基因，为深入研究桑椹肥大性菌核病的致病机制及防治技术开发提供了理论基础。