一个家蚕微孢子虫新基因的序列分析及蛋白质在酿酒酵母细胞中的定位
【期刊年份】2013年第02期
【作者姓名】罗洁 邓远洪 黄为 李田 杨琼 殷梅 潘国庆 李春峰 周泽扬
【作者单位】家蚕基因组生物学国家重点实验室,西南大学;重庆师范大学生命科学学院;广东省农业科学院蚕业与农产品加工
摘 要 微孢子虫具有基因组进行速度慢,但基因进化速度快的特征,不同微孢子虫间存在较多的共线性区域。通过比较基因组分析在家蚕微孢子虫(Nosema bombycis,Nb) CQ1株中发现一个编号为NBO32g0035的功能未知新基因,而在兔脑炎微孢子虫(Encephalitozoon cuniculi)和蜜蜂微孢子虫(Nosema ceranae)均无该基因的存在。该基因编码521个氨基酸,其中有131个酸性氨基酸和76个碱性氨基酸,赖氨酸含量最高,半胱氨酸有6个,SignalP3.0预测该基因编码的蛋白质无信号肽。采用RT-PCR方法在被N. bombycis CQ1株感染1~10 d的家蚕中肠组织中能检测到该基因转录活性,并且仅能在家蚕微孢子虫基因组中获得其克隆序列。对该基因的克隆测序表明其核苷酸序列具有多态性。通过转染单细胞模式生物——酿酒酵母检测发现,该基因编码的蛋白质不具有明显的亚细胞定位特征,主要分布在酿酒酵母细胞的细胞质中。研究结果表明这个家蚕微孢子虫新基因具有在感染初期表达、核苷酸多态性的特点,其编码蛋白质定位于酿酒酵母细胞的细胞质中。
关键词 家蚕微孢子虫;共线性区域;基因;多态性;转录;细胞定位