联系平台
- 国内刊号：CN 32-1115/S
- 国际刊号：ISSN 0257-4799
- 主管部门：中国科学技术协会
- 主办单位：中国蚕学会
中国农业科学院蚕业研究所 - 主编：李木旺
- 地址：江苏省镇江市丹徒区长晖路
666号 江苏科技大学期刊社 - 邮政编码：212100
- 电话：0511-85616835
- 信箱：canyekexue@126.com
- Q Q：849229965
柞蚕核型多角体病毒基因组编码MicroRNAs的预测与功能分析
【期刊年份】2013年第02期
【作者姓名】李文利 林澜 王乃红 栾雨时
【作者单位】大连理工大学生命科学与技术学院；沈阳药科大学生命科学与生物制药学院；山西省蚕业科学研究院
【作者姓名】李文利 林澜 王乃红 栾雨时
【作者单位】大连理工大学生命科学与技术学院；沈阳药科大学生命科学与生物制药学院；山西省蚕业科学研究院
摘 要 柞蚕核型多角体病毒(ApNPV)是危害柞蚕的主要病原物之一。病毒microRNAs(miRNA)是由病毒基因组编码的小RNA分子，在病毒繁殖及与宿主的相互作用中发挥作用。采用高通量测序Solexa技术测定ApNPV感染柞蚕后的miRNA，并通过vMir软件预测ApNPV基因组可能编码的miRNA前体序列。在预测得到的16条前体序列中，有13条能够从病毒感染的柞蚕蛹脂肪体中扩增出条带，并有10条能在病毒基因组中找到同源序列。在Solexa测序结果数据库中搜索到与这10条前体miRNAs相匹配的序列，并用RT-PCR方法证明有9条能扩增出大小相应的片段，确定其为病毒编码的miRNA的成熟序列。利用靶基因在线预测程序RNAhybrid预测到这些miRNA作用的135个可能的靶基因，其中有与免疫应答过程相关的基因36个,与免疫系统进程相关的基因19个,与免疫调节相关的基因8个,与免疫系统发育相关的基因9个。推测这些ApNPV基因组编码的miRNA在病毒与宿主之间的相互作用中扮演重要角色。
关键词 柞蚕核型多角体病毒； Solexa测序； miRNA；靶基因