家蚕orcokinin基因的选择性剪接与表达分析
摘要 Orcokinin(OK)是节肢动物门特有的一种神经肽,该神经肽自从在小龙虾中发现以来,便陆续在节肢动物门其他物种中鉴定到,然而由于其结构的复杂性和功能的多样性,对OK基因的结构与作用机制知之甚少。利用RACE克隆、qRT-PCR等方法对家蚕OK基因(BmOK)的结构与表达进行分析。结果表明BmOK存在选择性剪接,形成2个转录本BmOKA和BmOKB;BmOKA由外显子exon1、exon2、exon3、exon5、exon6、exon7和exon8组成,全长BmOKB由外显子exon1、exon2、exon3和exon4组成。BmOKA由于选择性剪接又有4个亚型,分别为BmOKA1(CDS长度为534 bp)、BmOKA2(CDS长度为564 bp)、BmOKA3(CDS长度为570 bp)和BmOKA4(CDS长度为600 bp),占比为22∶13∶5∶1,4个亚型有相同的5′ UTR(62 bp)和3′ UTR(188 bp);BmOKB只有一种CDS(864 bp),5′ UTR序列与BmOKA相同(62 bp),但3′ UTR(168 bp)不同。BmOKA主要在家蚕腹神经索表达,在4龄眠后18 h表达量最低;BmOKB在头部和中肠的表达量相对较高,眠期表达量高于其他时期。BmOKA与斜纹夜蛾Orcokinin同源性最高,完整蛋白质前体的同源性为33.80%。本研究清晰地展示了家蚕BmOK基因的结构与表达模式,为后续分析BmOK基因的功能奠定了理论基础并提供实验依据。