摘要  为明确柞蚕肠道细菌的菌群结构和多样性，利用Illumina MiSeq技术检测细菌16S rRNA基因序列的方法，比较分析柞蚕5龄中期幼虫中肠和中肠内容物的细菌类群。在柞蚕5龄幼虫中肠共发现了10个门、18个纲、38个目、55个科、68个属的细菌，而在中肠内容物中仅检测到5个门、9个纲、13个目、16个科、20个属的细菌。在门的水平上，中肠的优势菌群（丰度大于1%）为蓝细菌门Cyanobacteria （86.22%）、厚壁菌门Firmicutes（6.22%）、变形菌门Proteobacteria （5.55%）和放线菌门Actinobacteria （1.49%）；中肠内容物的优势菌来自蓝细菌门Cyanobacteria （93.86%）和厚壁菌门Firmicutes （5.18%）。在属的水平，柞蚕中肠的优势菌属为蓝细菌norank_c_ _Cyanobacteria（86.22%）、Tyzzerella_3（6.13%）、青枯菌属Ralstonia（3.78%）和红球菌属Rhodococcus（1.25%）；中肠内容物的优势菌属为蓝细菌norank_c_ _Cyanobacteria（93.86%）和Tyzzerella_3（5.08%）。水小杆菌属Aquabacterium等13个属在中肠的丰度是中肠内容物的4.92～130.32倍，而51个属在中肠内容物中没有检测到。中肠菌群的Chao指数和Ace指数均明显高于中肠内容物。结果表明，柞蚕中肠和中肠内容物的菌群结构在组分和丰度上均存在明显差异，总体上中肠内容物的菌群远不如中肠的菌群丰富。